1、江户川柯南：本故事的主人公。真实身份为高中生侦探工藤新一，由于被黑衣组织的成员灌下毒药aptx4869而导致身体变小，之后化名为“江户川柯南”，为了调查黑衣组织而寄住在毛利侦探事务所。就读于帝丹小学一年级b班，是少年侦探团成员。
2、工藤新一：17岁，帝丹高中二年级b班学生，高中生侦探，被称为“平成年代的福尔摩斯”、“日本警察的救世主”，很多案件在他的活跃之下得以侦破。后来被黑衣组织灌下毒药，身体变小。
3、毛利兰：16岁，本故事的女主角。帝丹高中二年级b班学生，毛利小五郎的女儿，帝丹高中空手道社的主将。毛利侦探事务所的女主人，新一青梅竹马的女友。将柯南像弟弟一样对待。